Hervé Deperrois rejoint FranceAgriMer, le 1er septembre 2010, au poste de secrétaire général. Il vient du Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (Cirad), dont il était également secrétaire général. Il a occupé les fonctions de directeur adjoint et chef du pôle bois sciages emballages au Centre technique du bois et de l’ameublement
(CTBA) et de secrétaire général de l’Agence française de sécurité sanitaire des aliments (Afssa).
Hervé Deperrois a également rempli plusieurs missions ministérielles : chargé de mission «qualité » à la direction générale de l’Alimentation (DGAL) du ministère de l’Agriculture, puis successivement à la direction du Budget du ministère des Finances, en charge du développement du contrôle de gestion dans les administrations et de la tutelle budgétaire des offices d’intervention agricole. Il est en outre lauréat 1989 de la Fondation nationale Entreprise et Performance sur le thème des « nouvelles formes de management face à la compétition économique».